SAINT SEIYA GEKIJOUBAN
~ movie 1 ~

A livello temporale, il film è collocato nel bel mezzo della prima serie televisiva.
 
Quando la pace è in pericolo, la dea Athena si reincarna sulla Terra e combatte le forze oscure insieme ai Cavalieri dello Zodiaco.

I bambini stanno giovando nel cortile dell'orfanotrofio, quando Sancho e Daisy, una collega di Lamia, stanno per essere investiti da una macchina. Vengono salvati da Crystal.
I Cavalieri dello Zodiaco trascorrono del tempo all'orfanotrofio, insieme ai bambini, spiegando loro i segreti del cosmo. Tra Daisy e Crystal nasce un tenero sentimento, ma, alla vista di una stella cadente, Daisy ha un cambio di umore e decide di rimanere da sola.
Come ipnotizzata, Daisy raggiunge il luogo dove è caduto il meteorite e trova una mela d'oro. Lo spirito della dea della discordia, Eris, si impossessa di lei. Dal suolo, sorge l'antico tempio di Eris e vengono resuscitati alcuni cavalieri, che le giurano fedeltà.
Il mattino dopo, Lady Isabel sta cavalcando, quando incontra Daisy nel bosco. Daisy, che ormai non è più in sè, la rapisce e la imprigiona nel suo tempio. Per risorgere completamente, a Eris non basta il corpo di Daisy, ma deve anche risucchiare l'energia vitale di Athena, tramite la mela d'oro.
Dopo aver lanciato la sfida ai Cavalieri dello Zodiaco, Eris convoca i suoi cavalieri: Lesia, Orfeo, Relta, Ian, Serian. Athena sopravviverà solo fino al tramonto, dopo di che, la sua energia sarà completamente risucchiata dalla mela.
Giunti al santuario di Eris, i Cavalieri dello Zodiaco si dividono. Pegasus si batte contro Lesia di Sagitta Oscura. Dopo un'iniziale difficoltà, Pegasus riesce a sconfiggere l'avversario col suo fulmine, ma viene colpito di striscio da una freccia avvelenata.
Nel frattempo, Crystal si imbatte in Relta della Croce del Sud. Con un po' di fatica, Crystal riesce a congelare Relta, ma arriva Eris a interrompere la battaglia. Daisy, la sua parte umana, è infatti attirata dal suo amato. Relta torna però all'attacco ed Eris lo trafigge con la sua lancia. Anche Crystal rimane ferito.
Pegasus inizia a stare male. Sirio combatte contro Ian dello Scudo, che vuole confrontare i due scudi prodigiosi. Ian vince la schermaglia, ma Sirio si riprende e riesce ad ucciderlo. Sirio, poi, cade a terra privo di forze.
Andromeda incontra Orfeo della Lira e viene messo facilmente fuori gioco. Purtoppo arriva Phoenix in suo aiuto. Dopo avergli lanciato un Fantasma Diabolico, senza effetto, Phoenix uccide Orfeo col le Ali della Fenice.
In qualche modo, Pegasus riesce ad arrivare al cospetto di Eris, ma il veleno gli ha ormai annebbiato la vista. E' quasi il tramonto ed Eris fuoriesce dal corpo di Daisy, assumendo la sua vera forma. Daisy cade a terra svenuta.
Serian di Orione, cavaliere leggendario, si sta prendendo gioco di Pegasus, quando arriva Phoenix in suo aiuto. Tuttavia, neanche Phoenix riesce a sconfiggere Serian e finisce a terra dopo qualche battuta. Athena, però, è ancora fiduciosa.
Serian butta giù Pegasus da una rupe. Phoenix e gli altri Cavalieri mezzi moribondi danno il loro supporto morale a Pegasus, che riprende le forze e risale dalla rupe. Serian sta per uccidere Phoenix, quando compare l'armatura del Sagittario, in aiuto di Pegasus. Con la nuova potente armatura, Pegasus sconfigge Serian con un sol colpo.
Il tempo stringe ed Eris sta per resuscitare altri cavalieri  ombra. Il suo scopo è mandare il mondo in rovina, dilaniato da un'eterna guerra. Pegasus estrae la freccia del Sagittario per rompere la mela, ma esita perchè rischia di uccidere Athena che si trova subito dietro. Alla fine si decide e scocca la freccia: non solo rompe la mela e salva Athena (la freccia non avrebbe mai ferito la sua dea), ma trafigge anche Eris che era sulla traiettoria.
Eris muore e il tempio crolla. Pegasus e Phoenix riescono a mettersi al riparo, ma non trovano gli altri. Dopo un po', dalla macerie emergono Andromeda, Sirio e Crystal con in braccio Daisy, salvati dal cosmo di Athena. Lieto fine.